期刊简介
中国科学技术协会主管，中华医学会主办，上海市医学会承办。本刊是消化专业学术期刊，属中华医学会系列杂志之一。以广大消化科医师为主要读者对象，兼顾腹部外科、消化内镜、放射影像、临床检验等相关专业，及时报道消化科领域领先的科研成果和临床诊疗经验，以及对消化科临床有指导作用、且与消化科临床密切结合的基础理论研究，对从事消化科专业的临床医师有指导作用。
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- 杂志名称：中华消化杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-1432
- 国内刊号：31-1367/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：期刊收录：CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
结直肠癌中CD44和上皮细胞黏附分子相关基因与通路的生物信息学研究
马敏星；周瑞；张嘉刚；马洪卫；陶文惠；赵秋；李瑾
关键词：CD44, EpCAM, 结直肠肿瘤, 肿瘤干细胞, 生物信息学, 基因芯片
摘要：目的 寻找结肠癌干细胞表面标志物CD44和上皮细胞黏附分子(EpCAM)表达密切相关的基因及其参与的生物过程.方法 通过生物信息学方法,利用基因表达精选集(GEO)数据库中结直肠癌基因芯片数据,结合R2平台,筛选出与CD44和EpCAM表达显著相关的基因,分析相关基因在不同性别、肿瘤家族史、是否饮酒、Dukes分期中的表达差异,并对比相关基因在其他肿瘤及正常人体组织中的表达情况.同时,利用基因本体及京都基因和基因组百科全书(KEGG)工具对与CD44和EpCAM表达显著相关基因进行基因本体和KEGG通路分析.利用R2平台内嵌统计学工具,采用单因素方差分析和连续校正的四格表卡方检验等进行统计学分析.结果 在此数据集315份结直肠癌标本中均检测出CD44和EpCAM表达,分别筛选出与CD44和EpCAM表达显著相关基因888个和6 316个.CD44与EpCAM共同正相关,且在全部315份样本中均有表达的5个基因的表达与不同性别、肿瘤家族史、是否饮酒、Dukes分期均无明显关系(P均＞0.05).通过与其他肿瘤及正常人体组织中的表达情况进一步对比发现,溶质载体家族12成员2(SLC12A2)、中心粒1蛋白组中心粒蛋白B(POC1B)2个基因在结直肠癌中的表达较其他肿瘤明显增高(F=289.422、128.456,P均＜0.01),并在结直肠癌中的表达较正常人体组织明显增高(F=349.519、128.456,P均＜0.01).对基因本体分析后发现,CD44和EpCAM表达均相关的基因共同涉及15条基因本体语义.对与CD44和EpCAM均相关的基因进行KEGG通路分析后发现,分别有7条和10条通路,差异均有统计学意义(P均＜0.01).结论 CD44和EpCAM在结直肠癌中普遍表达,与CD44和EpCAM表达相关的基因参与了多种肿瘤生物过程.
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