期刊简介
中国科学技术协会主管，中华医学会主办，上海市医学会承办。本刊是消化专业学术期刊，属中华医学会系列杂志之一。以广大消化科医师为主要读者对象，兼顾腹部外科、消化内镜、放射影像、临床检验等相关专业，及时报道消化科领域领先的科研成果和临床诊疗经验，以及对消化科临床有指导作用、且与消化科临床密切结合的基础理论研究，对从事消化科专业的临床医师有指导作用。
往期目录
-
1999
-
2000
-
2001
-
2002
-
2003
-
2004
-
2005
-
2006
-
2007
-
2008
-
2009
-
2010
-
2011
-
2012
-
2013
-
2014
-
2015
-
2016
-
2017
-
2018
-
2019
首页>中华消化杂志
- 杂志名称：中华消化杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-1432
- 国内刊号：31-1367/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：期刊收录：CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 万方收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
生物钟周期基因2与胰腺导管腺癌预后的相关性分析
曾玮；刘孟刚；刘宏鸣；谢斌；袁涛；杨俊涛；蓝翔；陈平
关键词：胰腺导管癌, Per2, 预后, 分子机制
摘要：目的寻找胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关基因并探讨其分子调控机制。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库中选取102例包含完整临床生存资料的 PDAC 患者的基因表达谱数据。从 Transfac 数据库中收集到106个转录因子调控基因集合。使用 PicTar 和 TargetScanS 算法收集到715个 miRNA 靶向调控基因集合。生物学通路数据来源于京都基因与基因组百科全书（KEGG）。已知癌基因数据来自癌基因普查（CGC）数据库。使用单因素 Cox 比例风险模型分析基因表达谱数据与生存时间的相关性，得到全基因组范围内的与生存相关的候选基因。使用超几何分布算法分析3种数据集的基因富集情况。使用 BH-FDR 算法进行多重矫正检验（要求假阳性率＜0．05）。采用 Kaplan-Meier 法对 PDAC 患者进行生存曲线分析。结果单因素 Cox 比例风险模型分析102例PDAC 患者数据后显示，有273个基因与患者的生存时间显著相关（P ＜0．0001）。将273个生存基因针对106个转录因子调控基因集合进行富集分析，得到12个富集生存基因的转录因子靶基因集合。将273个生存基因针对715个 miRNA 靶向调控基因集合进行富集分析，得到11个富集生存基因的miRNA 靶向调控基因集合。将273个生存基因针对 KEGG 通路数据进行富集分析，得到15个富集生存基因的生物学通路。生物钟周期基因2可能在转录水平受到转录因子 CCAAT 框/增强子蛋白（CEBPA）的调控，同时在转录后水平受到 miRNA-32的调控，进而通过昼夜节律通路影响 PDAC 的预后。102例 PDAC 患者按生物钟周期基因2表达量从高到低排序，前51例归为生物钟周期基因2高表达组，其余归为生物钟周期基因2低表达组，行 Kaplan-Meier 生存分析后显示，生物钟周期基因2与PDAC 的预后显著相关（P ＜0．01）。结论CEBPA/miRNA-32/生物钟周期基因2及其相关的生物钟节律通路可能是干预 PDAC 发展的靶通路，与 PDAC 预后相关。
友情链接